| Fr., 02.04.2004 | FC St. Pauli - Chemnitzer FC | 1:0 |
| Sa., 03.04.2004 | Eintracht Braunschweig - FC Schalke 04 II | 2:2 |
| Sa., 03.04.2004 | KFC Uerdingen - Borussia Dortmund II | 2:1 |
| Sa., 03.04.2004 | VfR Neumünster - FC Sachsen Leipzig | 2:1 |
| Sa., 03.04.2004 | SC Preußen Münster - Hamburger SV II | 1:0 |
| Sa., 03.04.2004 | Wuppertaler SV - Holstein Kiel | 2:1 |
| Sa., 03.04.2004 | 1. FC Dynamo Dresden - Rot-Weiß Essen | 0:0 |
| Sa., 03.04.2004 | SG Wattenscheid 09 - SC Paderborn | 1:1 |
| Mo., 05.04.2004 | SV Werder Bremen II - 1. FC Köln II | 1:1 |
| Sp. | S-U-N | Tore | Diff. | P | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. |  |  | Wuppertaler SV | 24 | 14-6-4 | 36:22 | 14 | 48 |
| 2. | |  | Rot-Weiß Essen | 25 | 14-5-6 | 45:20 | 25 | 47 |
| 3. | |  | SC Paderborn | 25 | 13-8-4 | 38:28 | 10 | 47 |
| 4. |  |  | SV Werder Bremen II | 25 | 13-7-5 | 42:27 | 15 | 46 |
| 5. | |  | 1. FC Dynamo Dresden | 25 | 11-11-3 | 33:20 | 13 | 44 |
| 6. |  |  | Borussia Dortmund II | 25 | 11-6-8 | 37:30 | 7 | 39 |
| 7. | |  | Chemnitzer FC | 25 | 11-3-11 | 26:29 | -3 | 36 |
| 8. | |  | KFC Uerdingen | 25 | 9-5-11 | 36:36 | 0 | 32 |
| 9. | |  | Eintracht Braunschweig | 25 | 9-5-11 | 31:32 | -1 | 32 |
| 10. | |  | FC St. Pauli | 25 | 8-6-11 | 33:29 | 4 | 30 |
| 11. | |  | 1. FC Köln II | 25 | 7-9-9 | 37:40 | -3 | 30 |
| 12. | |  | FC Schalke 04 II | 25 | 8-6-11 | 37:46 | -9 | 30 |
| 13. | |  | Holstein Kiel | 25 | 7-8-10 | 37:44 | -7 | 29 |
| 14. | |  | Hamburger SV II | 24 | 7-8-9 | 23:35 | -12 | 29 |
| 15. | |  | SG Wattenscheid 09 | 25 | 7-6-12 | 32:45 | -13 | 27 |
| 16. | |  | SC Preußen Münster | 25 | 5-10-10 | 25:33 | -8 | 25 |
| 17. | |  | FC Sachsen Leipzig | 25 | 4-10-11 | 29:37 | -8 | 22 |
| 18. | |  | VfR Neumünster | 25 | 2-9-14 | 25:49 | -24 | 15 |